Desde hace muchos años desarrollamos software para el laboratorio y la investigación. Un ejemplo es un proyecto de investigación de tres años que comenzó en 2021. El objetivo era una nueva plataforma para ensayos multiplex digitales. El equipo debe analizar a la vez muchísimas secuencias de ADN de una muestra, de forma más rápida y económica que hasta ahora. La base es la PCR digital.
La reacción en cadena de la polimerasa (PCR)
La PCR es un método estándar de la biología molecular para amplificar ADN. A lo largo de muchos ciclos, la enzima ADN polimerasa copia una secuencia de ADN buscada. Cada copia vuelve a servir de molde en el ciclo siguiente, de ahí el nombre de reacción en cadena. Desde su invención en 1983, la PCR forma parte del día a día de la investigación y del laboratorio, por ejemplo para detectar enfermedades hereditarias o virus.
PCR cuantitativa: medir mediante referencias
En la PCR cuantitativa en tiempo real, el equipo mide la fluorescencia durante la reacción. Las sondas marcadas emiten luz en cuanto encuentran el ADN buscado. Cuanto más ADN se genera, más brillante se vuelve la muestra. El método se dio a conocer con las pruebas durante la pandemia de COVID-19. La cantidad se obtiene por comparación con muestras de referencia. Por eso solo se determina de forma relativa.
PCR digital: contar en lugar de comparar
En la PCR digital, antes de la reacción la muestra se divide en miles de gotas o microcámaras diminutas. En cada una, la reacción transcurre por separado. Después se lee cada gota. Si emite luz, contenía el ADN buscado. A partir del número de gotas luminosas y oscuras puede calcularse estadísticamente la cantidad de ADN de toda la muestra. Sin muestras de referencia y con gran precisión.
La PCR digital es menos sensible a las sustancias que inhiben la reacción y detecta también cantidades muy pequeñas. Sin embargo, hasta ahora los equipos son bastante más caros que los de PCR cuantitativa. De ahí partía el proyecto.
Dónde ayuda el procesamiento de imágenes
Leer una a una miles de gotas o microcámaras es una tarea típica del procesamiento de imágenes. El software encuentra cada gota en la imagen, mide su fluorescencia, separa las luminosas de las oscuras y las cuenta. En los ensayos multiplex se añaden varios colores que debe distinguir con nitidez. Cuanto más fiable es este análisis, más preciso es el resultado.
Más sobre el tema
- Procesamiento de imágenes en el laboratorio
- Visión artificial industrial: desarrollo de software a medida
Hable con nosotros
¿Desarrolla un equipo de laboratorio o analiza imágenes de laboratorio? Descríbanos brevemente su tarea. Le responderemos con rapidez y le asesoraremos sin compromiso. Teléfono +49 761 28522110 o a través del formulario de contacto.
kununu